Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rrn3B2RS91 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms