Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ythdc2B2RR83 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ythdc2B2RR83 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms