Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phf3B2RQG2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms