Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nipsnap3aB1AWZ3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.6 ms