Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Palm3A2TJV2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Palm3A2TJV2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms