Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf39A2RT81 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms