Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Scn3aA2ASI5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Scn3aA2ASI5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms