Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SktA2AQ25 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SktA2AQ25 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms