Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tubb1A2AQ07 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb1A2AQ07 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms