Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lcn6A2AJB9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lcn6A2AJB9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lcn6A2AJB9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Lcn6A2AJB9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Lcn6A2AJB9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Lcn6A2AJB9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn6A2AJB9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms