Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rbbp8nlA2ABX0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms