Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prdm16A2A935 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prdm16A2A935 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms