Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prdm2A2A7B5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm2A2A7B5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms