Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkd2l1A2A259 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms