Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc173A0JLY1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc173A0JLY1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms