Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms