Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921501E09RikA0A0R4J054 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms