Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JGW8

Igkv12-89, Immunoglobulin kappa chain variable 12-89 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Igkv12-89A0A0G2JGW8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Igkv12-89A0A0G2JGW8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Igkv12-89A0A0G2JGW8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Igkv12-89A0A0G2JGW8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Igkv12-89A0A0G2JGW8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Igkv12-89A0A0G2JGW8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Igkv12-89A0A0G2JGW8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Igkv12-89A0A0G2JGW8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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