Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ldb3Q9JKS4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ldb3Q9JKS4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ldb3Q9JKS4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ldb3Q9JKS4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ldb3Q9JKS4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ldb3Q9JKS4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ldb3Q9JKS4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ldb3Q9JKS4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ldb3Q9JKS4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ldb3Q9JKS4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms