Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh2d4aQ9D7V1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh2d4aQ9D7V1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh2d4aQ9D7V1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh2d4aQ9D7V1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms