Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sdr42e1Q9D665 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sdr42e1Q9D665 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdr42e1Q9D665 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sdr42e1Q9D665 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.5 ms