Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp13a2Q9CTG6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp13a2Q9CTG6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp13a2Q9CTG6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp13a2Q9CTG6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp13a2Q9CTG6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp13a2Q9CTG6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms