Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apobec3Q99J72 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apobec3Q99J72 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apobec3Q99J72 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apobec3Q99J72 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apobec3Q99J72 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apobec3Q99J72 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apobec3Q99J72 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Apobec3Q99J72 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apobec3Q99J72 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apobec3Q99J72 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apobec3Q99J72 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apobec3Q99J72 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apobec3Q99J72 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apobec3Q99J72 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apobec3Q99J72 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apobec3Q99J72 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apobec3Q99J72 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apobec3Q99J72 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apobec3Q99J72 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apobec3Q99J72 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms