Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn16Q925N4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn16Q925N4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn16Q925N4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn16Q925N4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn16Q925N4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.5 ms