Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atad2Q8CDM1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atad2Q8CDM1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atad2Q8CDM1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atad2Q8CDM1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atad2Q8CDM1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atad2Q8CDM1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atad2Q8CDM1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atad2Q8CDM1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atad2Q8CDM1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atad2Q8CDM1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atad2Q8CDM1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atad2Q8CDM1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atad2Q8CDM1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Atad2Q8CDM1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atad2Q8CDM1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atad2Q8CDM1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atad2Q8CDM1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Atad2Q8CDM1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atad2Q8CDM1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atad2Q8CDM1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atad2Q8CDM1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Atad2Q8CDM1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Atad2Q8CDM1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atad2Q8CDM1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atad2Q8CDM1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Atad2Q8CDM1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atad2Q8CDM1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atad2Q8CDM1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Atad2Q8CDM1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms