Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnpo1Q8BFY9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnpo1Q8BFY9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnpo1Q8BFY9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnpo1Q8BFY9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms