Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Syne2Q6ZWQ0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Syne2Q6ZWQ0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Syne2Q6ZWQ0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Syne2Q6ZWQ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms