Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NesQ6P5H2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NesQ6P5H2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NesQ6P5H2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NesQ6P5H2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NesQ6P5H2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NesQ6P5H2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NesQ6P5H2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms