Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ift52Q62559 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ift52Q62559 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift52Q62559 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ift52Q62559 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms