Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Supt6hQ62383 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Supt6hQ62383 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Supt6hQ62383 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Supt6hQ62383 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Supt6hQ62383 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Supt6hQ62383 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Supt6hQ62383 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Supt6hQ62383 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Supt6hQ62383 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Supt6hQ62383 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Supt6hQ62383 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Supt6hQ62383 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Supt6hQ62383 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Supt6hQ62383 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Supt6hQ62383 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Supt6hQ62383 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Supt6hQ62383 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Supt6hQ62383 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Supt6hQ62383 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Supt6hQ62383 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Supt6hQ62383 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Supt6hQ62383 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Supt6hQ62383 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Supt6hQ62383 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Supt6hQ62383 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Supt6hQ62383 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Supt6hQ62383 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Supt6hQ62383 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Supt6hQ62383 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Supt6hQ62383 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Supt6hQ62383 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Supt6hQ62383 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Supt6hQ62383 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Supt6hQ62383 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Supt6hQ62383 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Supt6hQ62383 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Supt6hQ62383 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Supt6hQ62383 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Supt6hQ62383 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Supt6hQ62383 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Supt6hQ62383 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Supt6hQ62383 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Supt6hQ62383 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Supt6hQ62383 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Supt6hQ62383 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Supt6hQ62383 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Supt6hQ62383 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Supt6hQ62383 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Supt6hQ62383 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Supt6hQ62383 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Supt6hQ62383 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms