Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f1Q61501 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f1Q61501 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E2f1Q61501 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2f1Q61501 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms