Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E2

Repin1, Replication initiator 1, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Repin1Q5U4E2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Repin1Q5U4E2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Repin1Q5U4E2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Repin1Q5U4E2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Repin1Q5U4E2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Repin1Q5U4E2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Repin1Q5U4E2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Repin1Q5U4E2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Repin1Q5U4E2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Repin1Q5U4E2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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