Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hs3st6Q5GFD5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hs3st6Q5GFD5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hs3st6Q5GFD5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hs3st6Q5GFD5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hs3st6Q5GFD5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hs3st6Q5GFD5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hs3st6Q5GFD5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hs3st6Q5GFD5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hs3st6Q5GFD5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hs3st6Q5GFD5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hs3st6Q5GFD5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hs3st6Q5GFD5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hs3st6Q5GFD5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms