Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nhlrc4Q3UP44 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nhlrc4Q3UP44 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nhlrc4Q3UP44 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms