Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4dQ3U2K5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4dQ3U2K5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4dQ3U2K5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4dQ3U2K5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4dQ3U2K5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm4dQ3U2K5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm4dQ3U2K5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Kdm4dQ3U2K5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kdm4dQ3U2K5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kdm4dQ3U2K5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms