Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccbe1Q3MI99 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccbe1Q3MI99 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccbe1Q3MI99 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms