Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pi4k2aQ2TBE6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pi4k2aQ2TBE6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pi4k2aQ2TBE6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pi4k2aQ2TBE6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pi4k2aQ2TBE6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pi4k2aQ2TBE6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pi4k2aQ2TBE6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pi4k2aQ2TBE6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pi4k2aQ2TBE6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pi4k2aQ2TBE6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pi4k2aQ2TBE6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pi4k2aQ2TBE6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pi4k2aQ2TBE6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pi4k2aQ2TBE6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pi4k2aQ2TBE6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pi4k2aQ2TBE6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pi4k2aQ2TBE6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pi4k2aQ2TBE6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pi4k2aQ2TBE6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pi4k2aQ2TBE6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pi4k2aQ2TBE6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pi4k2aQ2TBE6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms