Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
F13bQ07968 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
F13bQ07968 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
F13bQ07968 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
F13bQ07968 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
F13bQ07968 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
F13bQ07968 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
F13bQ07968 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
F13bQ07968 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
F13bQ07968 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
F13bQ07968 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
F13bQ07968 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
F13bQ07968 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
F13bQ07968 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms