Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NrepQ07475 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NrepQ07475 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrepQ07475 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NrepQ07475 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NrepQ07475 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NrepQ07475 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrepQ07475 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NrepQ07475 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms