Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Traf5P70191 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Traf5P70191 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Traf5P70191 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Traf5P70191 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Traf5P70191 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Traf5P70191 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Traf5P70191 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Traf5P70191 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Traf5P70191 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Traf5P70191 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Traf5P70191 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Traf5P70191 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Traf5P70191 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Traf5P70191 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Traf5P70191 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Traf5P70191 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Traf5P70191 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Traf5P70191 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Traf5P70191 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Traf5P70191 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Traf5P70191 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Traf5P70191 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Traf5P70191 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Traf5P70191 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Traf5P70191 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Traf5P70191 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Traf5P70191 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Traf5P70191 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Traf5P70191 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms