Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FusP56959 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FusP56959 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FusP56959 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FusP56959 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FusP56959 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FusP56959 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FusP56959 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FusP56959 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FusP56959 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FusP56959 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FusP56959 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FusP56959 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FusP56959 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FusP56959 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FusP56959 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FusP56959 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FusP56959 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FusP56959 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FusP56959 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FusP56959 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FusP56959 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FusP56959 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FusP56959 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FusP56959 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FusP56959 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FusP56959 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FusP56959 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FusP56959 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FusP56959 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FusP56959 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FusP56959 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FusP56959 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FusP56959 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FusP56959 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FusP56959 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FusP56959 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FusP56959 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FusP56959 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FusP56959 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FusP56959 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FusP56959 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FusP56959 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FusP56959 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FusP56959 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FusP56959 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FusP56959 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FusP56959 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FusP56959 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FusP56959 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FusP56959 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FusP56959 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FusP56959 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FusP56959 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FusP56959 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FusP56959 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FusP56959 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FusP56959 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FusP56959 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FusP56959 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FusP56959 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FusP56959 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FusP56959 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FusP56959 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FusP56959 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FusP56959 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FusP56959 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FusP56959 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FusP56959 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FusP56959 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FusP56959 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FusP56959 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FusP56959 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FusP56959 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FusP56959 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FusP56959 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FusP56959 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FusP56959 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FusP56959 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FusP56959 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FusP56959 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FusP56959 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FusP56959 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FusP56959 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FusP56959 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FusP56959 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FusP56959 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FusP56959 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FusP56959 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FusP56959 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FusP56959 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FusP56959 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FusP56959 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FusP56959 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FusP56959 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FusP56959 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FusP56959 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FusP56959 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FusP56959 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FusP56959 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1183.3 ms