Protein–RNA interactions for Protein: P52480

Pkm, Pyruvate kinase PKM, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkmP52480 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PkmP52480 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PkmP52480 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PkmP52480 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PkmP52480 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PkmP52480 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PkmP52480 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PkmP52480 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PkmP52480 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PkmP52480 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PkmP52480 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PkmP52480 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PkmP52480 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PkmP52480 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PkmP52480 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PkmP52480 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PkmP52480 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PkmP52480 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PkmP52480 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PkmP52480 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PkmP52480 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PkmP52480 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PkmP52480 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PkmP52480 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PkmP52480 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PkmP52480 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PkmP52480 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PkmP52480 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PkmP52480 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PkmP52480 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PkmP52480 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PkmP52480 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PkmP52480 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PkmP52480 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PkmP52480 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PkmP52480 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PkmP52480 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PkmP52480 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PkmP52480 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PkmP52480 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PkmP52480 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PkmP52480 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PkmP52480 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PkmP52480 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PkmP52480 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PkmP52480 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PkmP52480 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PkmP52480 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PkmP52480 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PkmP52480 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PkmP52480 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PkmP52480 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PkmP52480 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PkmP52480 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PkmP52480 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PkmP52480 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PkmP52480 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PkmP52480 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PkmP52480 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PkmP52480 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PkmP52480 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PkmP52480 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PkmP52480 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PkmP52480 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PkmP52480 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PkmP52480 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PkmP52480 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PkmP52480 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PkmP52480 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PkmP52480 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PkmP52480 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PkmP52480 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PkmP52480 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PkmP52480 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PkmP52480 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PkmP52480 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PkmP52480 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PkmP52480 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PkmP52480 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PkmP52480 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PkmP52480 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PkmP52480 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PkmP52480 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PkmP52480 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PkmP52480 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PkmP52480 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PkmP52480 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PkmP52480 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PkmP52480 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PkmP52480 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PkmP52480 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PkmP52480 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PkmP52480 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PkmP52480 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PkmP52480 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PkmP52480 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PkmP52480 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PkmP52480 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PkmP52480 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PkmP52480 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms