Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SftpdP50404 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SftpdP50404 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SftpdP50404 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SftpdP50404 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SftpdP50404 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SftpdP50404 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SftpdP50404 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SftpdP50404 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SftpdP50404 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SftpdP50404 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SftpdP50404 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SftpdP50404 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SftpdP50404 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SftpdP50404 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SftpdP50404 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SftpdP50404 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SftpdP50404 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SftpdP50404 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SftpdP50404 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SftpdP50404 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SftpdP50404 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SftpdP50404 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SftpdP50404 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SftpdP50404 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SftpdP50404 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SftpdP50404 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SftpdP50404 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SftpdP50404 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SftpdP50404 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SftpdP50404 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SftpdP50404 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SftpdP50404 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SftpdP50404 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SftpdP50404 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SftpdP50404 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SftpdP50404 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SftpdP50404 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SftpdP50404 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SftpdP50404 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SftpdP50404 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SftpdP50404 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SftpdP50404 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SftpdP50404 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SftpdP50404 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SftpdP50404 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SftpdP50404 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SftpdP50404 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SftpdP50404 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SftpdP50404 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SftpdP50404 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SftpdP50404 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SftpdP50404 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SftpdP50404 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms