Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LtbrP50284 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LtbrP50284 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LtbrP50284 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LtbrP50284 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LtbrP50284 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LtbrP50284 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LtbrP50284 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LtbrP50284 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LtbrP50284 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LtbrP50284 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LtbrP50284 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LtbrP50284 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LtbrP50284 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LtbrP50284 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LtbrP50284 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LtbrP50284 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LtbrP50284 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LtbrP50284 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LtbrP50284 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LtbrP50284 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LtbrP50284 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LtbrP50284 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LtbrP50284 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LtbrP50284 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LtbrP50284 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LtbrP50284 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LtbrP50284 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LtbrP50284 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LtbrP50284 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LtbrP50284 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LtbrP50284 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LtbrP50284 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LtbrP50284 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LtbrP50284 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LtbrP50284 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LtbrP50284 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LtbrP50284 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LtbrP50284 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LtbrP50284 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LtbrP50284 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LtbrP50284 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LtbrP50284 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LtbrP50284 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LtbrP50284 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LtbrP50284 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LtbrP50284 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LtbrP50284 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LtbrP50284 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LtbrP50284 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LtbrP50284 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LtbrP50284 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LtbrP50284 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LtbrP50284 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LtbrP50284 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LtbrP50284 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LtbrP50284 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LtbrP50284 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LtbrP50284 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LtbrP50284 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LtbrP50284 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LtbrP50284 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LtbrP50284 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LtbrP50284 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms