Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Traf1P39428 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26,66■■□□□ 1,86
Traf1P39428 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Traf1P39428 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Traf1P39428 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Traf1P39428 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Traf1P39428 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Traf1P39428 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Traf1P39428 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Traf1P39428 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Traf1P39428 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Traf1P39428 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Traf1P39428 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Traf1P39428 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Traf1P39428 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Traf1P39428 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Traf1P39428 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Traf1P39428 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Traf1P39428 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Traf1P39428 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Traf1P39428 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Traf1P39428 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Traf1P39428 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Traf1P39428 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Traf1P39428 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Traf1P39428 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Traf1P39428 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Traf1P39428 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Traf1P39428 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Traf1P39428 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Traf1P39428 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Traf1P39428 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Traf1P39428 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Traf1P39428 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Traf1P39428 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Traf1P39428 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Traf1P39428 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26,45■■□□□ 1,83
Traf1P39428 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26,45■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Traf1P39428 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,8 ms