Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gap43P06837 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gap43P06837 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gap43P06837 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gap43P06837 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gap43P06837 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gap43P06837 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gap43P06837 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gap43P06837 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gap43P06837 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gap43P06837 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gap43P06837 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gap43P06837 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gap43P06837 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gap43P06837 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms