Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ88

Gm5145, Predicted pseudogene 5145, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5145F8VQ88 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5145F8VQ88 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5145F8VQ88 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5145F8VQ88 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm5145F8VQ88 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5145F8VQ88 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5145F8VQ88 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5145F8VQ88 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5145F8VQ88 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5145F8VQ88 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5145F8VQ88 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5145F8VQ88 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms