Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm29094F6Q785 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm29094F6Q785 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm29094F6Q785 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm29094F6Q785 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm29094F6Q785 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm29094F6Q785 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm29094F6Q785 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm29094F6Q785 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm29094F6Q785 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm29094F6Q785 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm29094F6Q785 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm29094F6Q785 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm29094F6Q785 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gm29094F6Q785 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm29094F6Q785 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm29094F6Q785 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm29094F6Q785 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms