Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NebE9Q1W3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
NebE9Q1W3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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