Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trappc11B2RXC1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trappc11B2RXC1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trappc11B2RXC1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trappc11B2RXC1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trappc11B2RXC1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms